L'organizzazione scolastica e la didattica moderna richiedono una disponibilità ampia di spazi dedicati . Va sottolineato anche che un principio che si fa strada recentemente è di "portare il laboratorio in classe": questo è possibile dato che tutte le aule sono tutte dotate di una postazione di PC fisso /portatile collegata a LIM o almeno ad un videoproiettore fisso a parete con diffusori acustici. Tutte le aule sono cablate per l'accesso in wi-fi a internet con connessione Fibra ad Alta Velocità (1Gb/sec).
dotato di 28 PC più quello del docente
con banconi per esercitazioni didattiche fornito di attrezzature audio-video e sussidi per esperimenti di meccanica, acustica, ottica, termologia, elettricità, magnetismo, radioattività
con banconi in gres porcellanato forniti di bunsen e ricca dotazione didattica
attrezzato e fornito di 14 microscopi didattici e di 1 microscopio professionale collegato al video mediante telecamera + vari modelli anatomici
collegata con il Catalogo Bibliografico Trentino dotata di circa 35.000 volumi (da preziosi incunaboli e cinquecentine alla produzione più recente) dotata di 1 postazione workstation per 4 utenti
allestita con proiettore per diapositive, episcopio, videoproiettore, sussidi audiotelevisivi e informatici; offre una ricca collezione di testi d'arte ed una cospicua diateca, principalmente di pittura ed architettura
a disposizione di allievi e studiosi sono poi le preziose
Il materiale scientifico, che a partire dal XIX secolo corredava il gabinetto di fisica e storia naturale, è catalogato nella sezione museale comprendente strumenti scientifici (laboratorio di fisica), raccolta naturalistica (laboratorio di chimica e biologia), tavole parietali (laboratori di chimica e fisica), carte geografiche. (cfr. Le collezioni scientifiche del Ginnasio-Liceo "Giovanni Prati" di Trento a cura di R. Mazzolini in Annali 1994 - 1997 a cura di L. de Finis)